Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGAP1Q07960 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGAP1Q07960 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms