Protein–RNA interactions for Protein: Q04864

REL, Proto-oncogene c-Rel, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELQ04864 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RELQ04864 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RELQ04864 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RELQ04864 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RELQ04864 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RELQ04864 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms