Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBP5P82980 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBP5P82980 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBP5P82980 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBP5P82980 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBP5P82980 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBP5P82980 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms