Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TMF1P82094 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TMF1P82094 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TMF1P82094 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TMF1P82094 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TMF1P82094 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMF1P82094 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TMF1P82094 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms