Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTG2P63267 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms