Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACTA2P62736 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms