Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SGSHP51688 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SGSHP51688 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SGSHP51688 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SGSHP51688 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SGSHP51688 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SGSHP51688 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SGSHP51688 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SGSHP51688 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SGSHP51688 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSHP51688 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSHP51688 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSHP51688 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSHP51688 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSHP51688 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SGSHP51688 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms