Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSN1S1P47710 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSN1S1P47710 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms