Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACTN2P35609 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTN2P35609 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms