Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GJB2P29033 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB2P29033 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GJB2P29033 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB2P29033 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB2P29033 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB2P29033 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB2P29033 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB2P29033 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB2P29033 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB2P29033 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB2P29033 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms