Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CTNNA2P26232 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTNNA2P26232 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms