Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C4BPBP20851 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms