Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRHP20396 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
TRHP20396 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRHP20396 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRHP20396 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRHP20396 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRHP20396 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TRHP20396 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRHP20396 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRHP20396 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRHP20396 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms