Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NR1D1P20393 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NR1D1P20393 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NR1D1P20393 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NR1D1P20393 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NR1D1P20393 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NR1D1P20393 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NR1D1P20393 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms