Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCM3APO60318 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM3APO60318 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms