Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.916e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.94e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.866e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.832e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.822e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OSBPL6-209ENST00000477646 386 ntTSL 420.13■□□□□ 0.816e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.736e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 BAD-206ENST00000544271 552 ntTSL 419.59■□□□□ 0.736e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.722e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASSF1-204ENST00000395117 1745 ntTSL 219.54■□□□□ 0.726e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AP5S1-204ENST00000455742 584 ntTSL 419.44■□□□□ 0.72e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.696e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.676e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OFD1-208ENST00000485052 685 ntTSL 319.17■□□□□ 0.666e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 C17orf62-228ENST00000583242 600 ntTSL 418.8■□□□□ 0.66e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.584e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 418.58■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POGLUT1-207ENST00000486607 1420 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.544e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DDX31-207ENST00000482620 1051 ntTSL 518.35■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.526e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EPHX1-204ENST00000448202 895 ntTSL 218.17■□□□□ 0.56e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 518.12■□□□□ 0.496e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.426e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 TRIM56-203ENST00000467847 581 ntTSL 217.24■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 C17orf62-240ENST00000585115 609 ntTSL 417.2■□□□□ 0.346e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC136-211ENST00000485998 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.18■□□□□ 0.346e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POGLUT1-208ENST00000497447 1361 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-211ENST00000589100 2303 ntTSL 516.98■□□□□ 0.316e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 316.97■□□□□ 0.317e-14■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RIPOR1-208ENST00000562755 538 ntTSL 416.92■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-13■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.226e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.226e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-218ENST00000489848 1576 ntTSL 216.37■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ING1-205ENST00000464141 340 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.216e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.197e-14■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 KCTD15-203ENST00000587559 622 ntTSL 416.19■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MARVELD1-204ENST00000451097 610 ntTSL 316.15■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.176e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-211ENST00000472637 2179 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-209ENST00000470663 545 ntTSL 415.66■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.086e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.069e-29■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-211ENST00000520610 1120 ntTSL 515.35■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RIPOR1-213ENST00000566522 592 ntTSL 515.26■□□□□ 0.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SUMF1-204ENST00000448413 3150 ntTSL 215.21■□□□□ 0.039e-24■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RPAP2-202ENST00000484158 1038 ntTSL 215.13■□□□□ 0.016e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RIPOR1-207ENST00000562116 244 ntTSL 315.02■□□□□ -06e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-206ENST00000518329 812 ntTSL 214.96□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-203ENST00000430911 933 ntTSL 214.89□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-206ENST00000468833 1170 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-219ENST00000491121 578 ntTSL 414.88□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-220ENST00000494164 741 ntTSL 414.87□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-203ENST00000460410 947 ntTSL 314.87□□□□□ -0.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 C17orf62-235ENST00000584791 559 ntTSL 214.84□□□□□ -0.036e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.044e-11■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-218ENST00000522461 575 ntTSL 414.68□□□□□ -0.066e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.066e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-214ENST00000473284 2056 ntTSL 214.54□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-217ENST00000521737 559 ntTSL 514.41□□□□□ -0.16e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-209ENST00000588404 2749 ntTSL 514.35□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-213ENST00000589474 2592 ntTSL 514.18□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-212ENST00000589358 2634 ntTSL 514.17□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POGLUT1-202ENST00000390401 731 ntTSL 314.09□□□□□ -0.152e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SGSM3-204ENST00000457767 1086 ntTSL 214.06□□□□□ -0.166e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.176e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-220ENST00000522608 769 ntTSL 513.76□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-211ENST00000485959 682 ntTSL 513.5□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-205ENST00000462295 1382 ntTSL 213.48□□□□□ -0.256e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-207ENST00000469169 1817 ntTSL 213.4□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SGSM3-213ENST00000485962 2973 ntTSL 513.37□□□□□ -0.276e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NT5DC1-203ENST00000419791 667 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-14■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-204ENST00000407272 1947 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GSKIP-204ENST00000555088 648 ntTSL 513.24□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-224ENST00000524064 819 ntTSL 513.15□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-210ENST00000519407 598 ntTSL 313.1□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-215ENST00000521503 446 ntTSL 413.1□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-208ENST00000587753 3011 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.324e-21■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 313.02□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 35.7
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