Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLRF2D3W0D1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLRF2D3W0D1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms