Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MCRIP1C9JLW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms