Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RHBDD3Q9Y3P4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms