Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
USP36Q9P275 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
USP36Q9P275 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms