Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC52A2Q9HAB3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC52A2Q9HAB3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms