Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TIMM29Q9BSF4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIMM29Q9BSF4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms