Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 FGFR1-229ENST00000526742 657 ntTSL 49.86□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 FGFR1-233ENST00000529552 688 ntTSL 48.86□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 FGFR1-240ENST00000533668 571 ntTSL 57.87□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 DLD-202ENST00000415325 1802 ntTSL 211.37□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 DLD-205ENST00000440410 1993 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.175e-7■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 DLD-207ENST00000451081 930 ntTSL 1 (best)5.99□□□□□ -1.455e-7■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.685e-7■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 DLD-203ENST00000417551 2041 ntTSL 53.74□□□□□ -1.815e-7■■■■■ 57.9
TBRG4Q969Z0 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 57.7
TBRG4Q969Z0 LDLRAD4-206ENST00000586207 545 ntTSL 416.99■□□□□ 0.311e-8■■■■■ 57.7
TBRG4Q969Z0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 318.45■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.513e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 EHMT1-220ENST00000626216 558 ntTSL 313.69□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 SHANK2-221ENST00000618363 434 ntTSL 311.48□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 EHMT1-241ENST00000637335 86 ntTSL 510.6□□□□□ -0.713e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MAD1L1-214ENST00000459731 371 ntTSL 310.56□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 AL590627.2-202ENST00000636318 138 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 TRNT1-209ENST00000465998 520 ntTSL 410.36□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MBIP-202ENST00000359527 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 TRNT1-208ENST00000434583 1871 ntTSL 29.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MBIP-201ENST00000318473 1586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 TRNT1-203ENST00000339437 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 PTK2-255ENST00000524202 3014 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MNAT1-209ENST00000557134 680 ntTSL 33.44□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MBIP-209ENST00000604768 444 ntTSL 52.2□□□□□ -2.061e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MNAT1-204ENST00000554002 616 ntTSL 31.37□□□□□ -2.191e-6■■■■■ 57.5
TBRG4Q969Z0 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 57.4
TBRG4Q969Z0 MYO9B-207ENST00000595641 6215 ntTSL 514.11□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 57.4
TBRG4Q969Z0 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 57.4
TBRG4Q969Z0 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 57.4
TBRG4Q969Z0 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.047e-7■■■■■ 57.4
TBRG4Q969Z0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.178e-8■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 516.37■□□□□ 0.218e-8■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 ZNF276-209ENST00000568295 2206 ntTSL 225.47■■□□□ 1.678e-16■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.578e-16■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.778e-16■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 COTL1-204ENST00000564662 713 ntTSL 219.38■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.198e-16■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 ZNF276-204ENST00000562530 1826 ntTSL 215.64■□□□□ 0.098e-16■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 ZNF276-206ENST00000563983 3403 ntTSL 212.11□□□□□ -0.478e-16■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 RAB17-211ENST00000487008 558 ntTSL 315.68■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 57.3
TBRG4Q969Z0 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 319.94■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.855e-9■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 219.82■□□□□ 0.765e-9■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.045e-9■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.11e-7■■■■■ 57.2
TBRG4Q969Z0 WDR20-213ENST00000557485 491 ntTSL 318.98■□□□□ 0.631e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-209ENST00000556094 785 ntTSL 317.58■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-204ENST00000342702 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-210ENST00000556511 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-207ENST00000555879 2175 ntTSL 210.19□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-201ENST00000299135 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-206ENST00000454394 2067 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.951e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WDR20-217ENST00000558854 532 ntTSL 23.42□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 57
TBRG4Q969Z0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 WARS-220ENST00000554950 1376 ntTSL 29.55□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.799e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.359e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 SLC22A23-208ENST00000482874 622 ntTSL 323.14■■□□□ 1.297e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 AMN-202ENST00000541086 2269 ntTSL 222.56■■□□□ 1.29e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 521.37■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-212ENST00000520134 592 ntTSL 321.37■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-211ENST00000520019 831 ntTSL 321.37■■□□□ 1.014e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-208ENST00000519616 522 ntTSL 520.6■□□□□ 0.894e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.683e-6■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 418.78■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-203ENST00000518168 1013 ntTSL 218.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-206ENST00000542215 1592 ntTSL 217.46■□□□□ 0.397e-8■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MGAT4B-222ENST00000523329 543 ntTSL 317.13■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 56.9
TBRG4Q969Z0 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 516.66■□□□□ 0.267e-8■■■■■ 56.9
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 147.4 ms