Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
TOPBP1Q92547 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TOPBP1Q92547 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TOPBP1Q92547 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms