Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM87AQ8NBN3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM87AQ8NBN3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms