Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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