Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHOT1Q8IXI2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RHOT1Q8IXI2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms