Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA2Q69YH5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA2Q69YH5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA2Q69YH5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA2Q69YH5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDCA2Q69YH5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDCA2Q69YH5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDCA2Q69YH5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms