Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOCADQ5VW36 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOCADQ5VW36 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms