Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBK1Q52WX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBK1Q52WX2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBK1Q52WX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SBK1Q52WX2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SBK1Q52WX2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms