Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFX7Q2KHR2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RFX7Q2KHR2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms