Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE3CQ15386 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBE3CQ15386 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
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