Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
UBE2V1Q13404 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
UBE2V1Q13404 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms