Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SYCNQ0VAF6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SYCNQ0VAF6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms