Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NKX2-5P52952 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms