Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RND2P52198 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RND2P52198 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RND2P52198 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RND2P52198 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RND2P52198 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RND2P52198 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms