Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MYH3P11055 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MYH3P11055 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MYH3P11055 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MYH3P11055 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MYH3P11055 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH3P11055 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH3P11055 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH3P11055 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MYH3P11055 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYH3P11055 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYH3P11055 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYH3P11055 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYH3P11055 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms