Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC192P0DO97 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC192P0DO97 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms