Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRGC1P0CF51 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRGC1P0CF51 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRGC1P0CF51 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRGC1P0CF51 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms