Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MMP3P08254 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP3P08254 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MMP3P08254 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MMP3P08254 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MMP3P08254 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MMP3P08254 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MMP3P08254 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms