Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKAP2O75563 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKAP2O75563 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms