Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA2O43364 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA2O43364 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms