Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CDO00329 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms