Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COLCA2A8K830 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms