Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms