Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SERP1Q9Y6X1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms