Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX24Q9Y343 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms