Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SS18L2Q9UHA2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms