Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VAMP8Q9BV40 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAMP8Q9BV40 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms