Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT11Q9BT88 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms